Bombeo y contención: la mayor parte del agua debe bombearse desde su fuente o dirigirse a tuberías o tanques de retención. Para evitar agregar contaminantes al agua, esta infraestructura física debe estar hecha de materiales apropiados y construida de manera que no ocurra contaminación accidental.

Cribado (ver también filtro de pantalla): el primer paso para purificar el agua superficial es eliminar los desechos grandes como palos, hojas, basura y otras partículas grandes que pueden interferir con los pasos de purificación posteriores. La mayoría de las aguas subterráneas profundas no necesitan cribado antes de otros pasos de purificación.

Almacenamiento: el agua de los ríos también se puede almacenar en los embalses de las orillas por períodos entre unos pocos días y muchos meses para permitir que tenga lugar la purificación biológica natural. Esto es especialmente importante si el tratamiento se realiza mediante filtros de arena lentos. Los depósitos de almacenamiento también proporcionan un amortiguador contra períodos cortos de sequía o para permitir que se mantenga el suministro de agua durante incidentes de contaminación transitoria en el río fuente.

Precloración: en muchas plantas, el agua entrante fue clorada para minimizar el crecimiento de organismos contaminantes en las tuberías y los tanques. Debido a los posibles efectos adversos sobre la calidad (ver cloro a continuación), esto se ha descontinuado en gran medida